小牛胸腺DNA的制備——濃鹽法
目的要求
了解從動物組織中提取基因組DNA的方法。
實驗原理
DNA在生物體內是以與蛋白質形成復合物的形式存在的,因此提取出脫氧核糖核酸蛋白復合物(DNP)后,必須將其中的蛋白質除去。小牛胸腺,魚類精子和植物種子的胚等含有豐富的DNA,可作為提取DNA的良好材料。動物和植物組織的脫氧核糖核蛋白可溶于水或濃鹽溶液,但在0.14mol/L鹽溶液中的溶解度很低,而核糖核蛋白則溶于0.14mol/L鹽溶液中,利用這一性質可將脫氧核糖核蛋白與核糖核蛋白以及其他雜質分開,當核蛋白與氯仿一起振蕩時,蛋白質變性而與核酸分開,核酸繼續保留于水相中,再用乙醇將水相中的DNA沉淀出來。
為除去DNA制品混雜的RNA,可用核糖核酸酶處理。大部分多糖在用乙醇或異丙醇分級沉淀時即被除去,如需要還可以進一步通過柱層析或電泳加以純化。
試劑和器材
1)、試劑
0.1mol/L氯化鈉—0.05mol/L、pH7.0檸檬酸鈉緩沖液;先配制0.05mol/L,pH—7.0檸檬酸鈉緩沖液,然后將氯化鈉溶于此緩沖溶液中,使其最終濃度達到0.1mol/L。
10%氯化鈉溶液;氯仿異戊醇混合液;95%乙醇,無水乙醇。
2)、材料
小牛胸腺
3)、器材
組織搗碎機、離心機、玻璃勻漿器。
操作方法
1、取新鮮的小牛胸腺,除去血水和結締組織,在水浴上切成小塊,稱取20g,加入2倍體積的0.1mol/L氯化鈉—0.05mol/L,pH=7.0檸檬酸鈉緩沖溶液,于組織搗碎機上高速勻漿5min。
2、組織糜用轉速為3000r/min的離心機離心15min,將沉淀用50mL上述緩沖溶液洗滌2次,洗滌時用勻漿器研磨洗滌,每次如前離心。
3、向最后得到的細胞核沉淀中加入6倍體積的10%氯化鈉溶液,充分攪勻置冰箱中過夜,以充分提取DNP,溶液為黏稠狀。
4、將所得的半透明黏稠狀液體,用滴管慢慢注入冷蒸餾水中,邊加邊輕輕攪動,這時有白色絲狀物——核蛋白析出,在冰箱中靜置數小時,收集沉淀。將沉淀物再溶于4倍體積的10%氯化鈉溶液中,迅速攪拌以加速溶解。
5、加入1/2體積的氯仿異戊醇混合液,劇烈振蕩5min左右,用轉速為3000r/min的離心機離心15min,得三層:上層為含有DNA和DNA核蛋白的水層,下層為氯仿異戊醇的有機溶劑層,變性蛋白質介于兩層之間。
6、吸出上面的水層,再用氯仿異戊醇如前進行脫蛋白,直至界面處不再出現變性蛋白質為止。
7、最后吸出上清液并將其注入兩倍體積的95%乙醇中,用玻璃棒攪起白色纖維狀DNA沉淀,瀝干,用80%乙醇洗滌,最后用少量無水乙醇洗滌。盡量瀝干乙醇后,鋪開在表面皿上。置于真空干燥器內干燥,既得白色纖維DNA鈉鹽。
注意事項
(1)、由于DNA主要存在于細胞核中,為了便于提取DNA,應嚴格控制胸腺破碎的條件,既要將細胞膜破碎,又要盡可能避免細胞核被破壞,導致DNA釋放而被斷裂。
(2)、在用氯仿異戊醇除去組織蛋白時,要劇烈振蕩使蛋白變性。若振蕩不夠,蛋白質不能很好除去,則影響DNA制品的質量。